La Serie Pycnacantha se caracteriza por presentar 3 o 5 espinas centrales robustas y curvadas hacia el cuerpo. La Serie Pycnacantha está compuesta por ; C.pycnacantha y C.tripugionacantha
La Serie Cornifera se caracteriza por presentar los tubérculos porrectos y una o ninguna espina central. Está compuesta por; C.cornifera, C.nickelsiae, C.pseudonickelsiae, C.compacta, C.recurvata, C.recurvata.subsp.canatlanensis, C.delicata, C.neglecta, C.pseudoechinus y C.pseudoechinus.subsp.laui
La Serie Coryphantha presenta los tubérculos derechos y cónicos y la componen; C.maiz-tablasensis, Csulcata, C.hintoniorum, C.hintoniorum.subsp.geoffreyii.
La Serie Salinensis es una de las más espinadas del género y una de sus características morfológicas está en los tubérculos que crecen pegados al cuerpo dando a la planta un aspecto apiñado y la componen; C.kracikii, C.salinensis, C.difficilis, C.durangensis, C.durangensis.subsp.cuencamensis, C.longicornis, C.pallida y C.pallida.subsp.calipensis
La Serie Retusa se caracteriza por unos cuerpos y tubérculos anchos y grandes y una robustísima espinación formada únicamente por espinas radiales muy desarrolladas.(por regla general carecen de espina central)
La Serie Retusa incluye; C.retusa y C.elephantidens con sus tres subespecies subs.elephantidens, subs.bumamma y subs.greenwoodii